皖南医学院第二附属医院是安徽省医院感染监控网成员单位，为医院的一级科室，由医院党委书记李萍、院长黄后宝直接领导。现有专职人员7人，包括护理专业3人、医疗专业1人、公卫专业2人、卫生管理专业1人，其中高级职称1人、中级4人、初级职称2人；另有兼职微生物专业人员1名。具有三级网络医院感染管理体系及医院感染防控制度，感控督导员感染防控督察机制。
感染管理科始终树立服务意识，深入临床一线，开展工作包括医院感染病例全面综合性监测和重点科室及重点部位的目标监测、医院消毒隔离管理、无菌操作管理、抗菌药物管理、多重耐药菌及细菌耐药监测、医疗废物管理、消毒灭菌质量控制、环境卫生学监测、手卫生监测、一次性消毒药械及医疗用品索证管理、突发公共卫生事件处置、医院感染知识培训等。科室连续15年举办省、市级医院感染继续教育项目，对全体医护人员进行医院感染知识集中培训，每年对新职工、实习生、保洁人员等进行医院感染相关知识培训及考核，每季度编印《医院感染通讯》。定期召开医院感染工作会议、医院感染委员会议、多重耐药菌联席会议，坚持多部门合作解决医院感染管理中的问题、及时发布细菌耐药趋势及预警，通报医院感染管理中的成效和隐患，落实医院感染防控措施。
自2019年新冠疫情肺炎暴发以来，感染管理科积极承担起医院疫情防控的重担，按照国家、省、市卫健委的工作部署和要求，积极投身到疫情防控阻击战中。制定新冠病毒院感防控制度、流程，规范全院疫情防控措施；严格督导检查、全面排查感染隐患，感染管理科采用“日督察、日反馈”的形式，对发热门诊、预检分诊、核酸采集点等高风险部门进行督察指导，发现问题及时反馈解决，将疫情防控措施落到实处；强化学习，提升全院防控水平，通过院感知识竞赛、应急演练、个人防护用品穿脱等多种形式强化医务人员疫情防控能力及感染防控技能；同舟共济，全力做好外援疫情防控工作，先后奔赴上海、黄山、铜陵、宿州、阜阳等多地进行疫情防控指导。
近年来，感染管理科在工作上精益求精，科学创新，荣获诸多荣誉。2017年在安徽省第12届医院感染管理学术年会“手卫生PDCA”评选中荣获优秀奖、2022年手卫生案例“净手相护，安全有我——践行《医务人员手卫生规范》提高外科手消毒合格率”入选国家级案例；2018年感染管理科被评为本年度“共产党员示范岗”；荣获2014、2015、2016、2017、2020、2021年度优秀科室，荣获2019年度集体“感控之星”称号；感染管理科主任刘安云2020年荣获安徽省医院感染管理暨新冠肺炎防控优秀个人，2020年荣获皖南医学院第二附属医院新冠肺炎疫情防控工作先进个人，2021年荣获皖南医学院“优秀共产党员”称号。
