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基础实验室组建于2017年，拥有分子生物学实验室2个、细胞培养间1个以及清洁级动物房、低温冰箱室和高压灭菌室，总面积约100平方米，配套设施齐全。拥有教学科研仪器设备40余台，包括PCR仪（美国，Life Technologies公司）、蛋白免疫印迹设备（迷你双垂直电泳槽、化学发光成像系统、转移电泳槽、转印电泳仪）、超纯水机、制冰机、微量核酸蛋白检测仪、酶标仪、自动洗板机、倒置荧光显微镜、超声破碎仪、二氧化碳培养箱、超声波清洗仪、酸度计、水浴锅、超低温冰箱、精密电子分析天平、普通离心机、低速冷冻离心机、真空干燥机、烘箱、液氮罐等。
目前可开展基本的分子生物学实验，如DNA/RNA提取电泳、PCR试验、免疫印迹（Western blotting）、单个核细胞分离、ELISA检测、微生物培养、细胞培养、动物实验等。同时本实验室已开展新型材料合成实验，并结合生物医学特征进行探索。如纳米锌筏承载药物靶向治疗、尿素纳米胶囊用于幽门螺杆菌治疗，生物脂质体包裹核酸的靶向治疗等。
本中心主要为院内临床科研提供服务，如临床标本的存储、检测以及数据处理。目前，医院一些科室已经积极入驻我中心，并且有专职的科研技术骨干进行对接。同时我中心也积极为皖南医学院本科教学提供服务，提高并丰富本科生科研素质和内涵，为学生毕业多方向择业打下基础。实验室还为部分本科同学组建了科研兴趣小组，并且给予实验仪器的操作培训，实验技术的培训、实验项目的实地操作及指导学生毕业论文的实验及书写等。在实践中，实验室依据不同专业的学科特色，针对性的对不同专业的学生施以专业相关的技术教学，并且越来越多的学生积极申请加入科研兴趣小组，实验室积极安排并尽量满足学生的需求。目前受制于客观条件的限制，其接收能力有限，有待于后期软件及硬件条件的进一步完善，届时基础实验室将为我院及学校师生员工的科研诉求竭诚服务。
